30 ноября 2021 года после обильных суточных дождей, в результате недобросовестных действий подрядчика, производивших ремонт кровли корпуса N16, произошло затопление технического этажа корпуса, с частичным попаданием воды в оперблок. Силами АХЧ последствия затопления были ликвидированы. С прежним подрядчиком контракт расторгнут, ведётся претензионная работа. С новым подрядчиком заключается договор на устранения недоделок.

В настоящее время оперблок Пензенской областной клинической больницы им. Н.Н. Бурденко работает в штатном режиме.